1918–1920
11 ноября 1918 г. было сформировано Временное правительство Эстонии. Принятым 18 ноября 1918 г. Постановлением об учреждении временных судов было положено начало созданию прокуратуры. В подчинении Министерства суда была создана должность Прокурора Эстонской Республики.
Решением Временного правительства прокурором Эстонской Республики был назначен Яан Теэмант, который состоял в этой должности с 11 ноября 1918 г. по 8 мая 1919 г.
Прокуроры 1918–1920
Jaan Teemant
1918–1918
Aleksander Hellat
1919–1919
Lui Olesk
1919
Alfred Maurer
1919–1920
Gallery
1920–1940
В апреле 1920 года должность Прокурора Республики была упразднена, и были сформированы отдельные Прокуратура Судебной палаты и Прокуратура Государственного суда.
Прокуратура Государственного суда была в основном защитником законности и высказывающим мнение учреждением. Работа Прокуратуры Судебной палаты заключалась в представлении и поддержке обвинения. Прокуратура Государственного суда выступала в качестве собственно прокуратуры только четыре раза, когда Государственный суд рассматривал по существу конкретные судебные дела.
В 1940 году советская власть ликвидировала суды Эстонской Республики и действовавшие при них прокуратуры, и 23 октября 1940 г. была учреждена Прокуратура Эстонской ССР.
Прокуроры Государственного суда 1920–1940
Richard Räägo
1922–1939
Johan Müller
1939–1940
Прокуроры Судебной палаты 1920–1940
Erich Eek
1921–1922
Paul Peterson
1921–?
Paul Välbe
?–1925
Johan Müller
1925–1933
Albert Assor
1933–1938
Johan Müller
1939–1940
Gustav Avald
1940
Gallery
С 1991 года
Решением Президиума Верховного Совета Эстонской Республики от 27 августа 1991 г. «Об отделении Прокуратуры Эстонской Республики от Прокуратуры СССР» была учреждена Прокуратура Эстонской Республики.
25 февраля 1993 г. Рийгикогу принял Закон о прокуратуре, которым была образована текущая структура прокуратуры.
Государственные генпрокуроры с 1991 г.
Leo Urge
1991–1993
Indrek Meelak
1993–1998
Alar Kirs(kohusetäitjana)
1998
Raivo Sepp
1998–2003
Jüri Pihl
2003–2005
Norman Aas
2005–2014
Lavly Perling
2014–2019
2020–...